阿尔法氨基酸的命名是根据其结构来命名的。阿尔法法是指阿尔法碳，即为与羧基直接相连的第一个碳原子，阿尔法氨基也就是阿尔法碳上有一个氨基。也就是高中生物(不清楚之后是不是)中所说的“至少有一个氨基和一个氨基连接在同一个碳原子上”。