长江白鲟的学名其实是白鲟，只不过它的主要栖息地在长江中下游，因此才有了这个名字。白鲟属于鲟形目下的鱼类，与达氏鲟、中华鲟属于同目成员，不过，白鲟属于匙吻鲟科。

匙吻鲟科是一个古老的鱼科，它们早在距今约1.5亿年前的白垩纪就出现在了地球上，并且有着至少7种以上的物种，只不过在白垩纪末期的灭绝事件中，古白鲟属、原白鲟属、缀鳞鲟属下的匙吻鲟都灭绝了，只剩下了匙吻鲟属和白鲟属两个属。