芽孢是有些细菌（多为杆菌）在一定条件下，细胞质高度浓缩脱水所形成的一种抗逆性很强的球形或椭圆形的休眠体。可以在不良环境下长期保持生命。一旦生存环境好转，芽孢会重新萌发成营养细胞。

这里所说的结晶体应该是伴孢晶体。

少数芽孢杆菌，如苏云金芽孢杆菌，在形成芽孢的同时，会在芽孢旁形成一颗菱形、方形或双锥形的碱溶性蛋白质晶体，称为伴孢晶体。

伴孢晶体不是生物，它只是蛋白质结晶。伴孢晶体通常对其它生物具有毒性，以此保护孢子的生命。不同的菌株产生的伴孢晶体，有不同的对宿主制毒范围。