花叶滇苦菜和大蓟就比较容易进行区分了，二者的在花的颜色上面就有很大的不同，花叶滇苦菜的花是黄色的，而大蓟的花多是紫色的。

大蓟的叶子虽然和花叶滇苦菜很是相似，不过的就是花叶滇苦菜的叶子上面是有一层白色的绒毛覆盖的，并且有些大蓟的叶子边缘多是呈锯齿状的。