种族不同：蒲瓜是属于南瓜族。冬瓜则是属于冬瓜族的。这两种完全是不一样的种族。

形状不同：蒲瓜的果实大多为圆筒状或棒槌状，瓜不仅有圆筒状，还有短筒状和束腰形状还有扁圆状。

根系区别：冬瓜根系发达，茎为蔓性，可以长达3～4米，分枝性强。蒲瓜全株密生软毛，具卷须，能匍匐地面或攀附他物生长。