交替途径是指一条从呼吸链泛醌处分支，以交替氧化酶为末端氧化酶的非磷酸化电子传递链。

由于它不受跨膜质子梯度及ATP/ADP比例的限制，可以绕过氧化磷酸化过程，直接快速消耗NAD(P)H，因此它可以消耗电子传递链上过多的电子，防止呼吸链的过氧化。

近年来的研究表明，AOX途径能够减少活性氧的产生，在植物抗逆过程中发挥重要作用。