少年歌行小说中瑾萱最后的结局是死在了仙界的战场上。

少年歌行小说中瑾萱在仙界开启圣战的时候跟随扶摇宗的圣主来到北极冰原驻守北泽长城，随后不死血族的大军开始进攻北泽长城，最终瑾萱在与不死血族的魔师对战时被李奇伟偷袭最终导致身死。