武动乾坤中的元门的结局被林动等人彻底覆灭，这是因为元门不仅投降了域外邪魔，并且成功的围攻东玄域的强者，重创了道宗和九天太清宫，可以说这样的元门结局是咎由自取的结局，元门也被林动带领的药族强大的数十位转轮境界强者成功覆灭。