区别有:一、车辆转让协议重点在转让车辆，可以是有偿转让，也可以是无偿转让。买卖合同是一方给付金钱，另一方给付标的物的合同。

二、车辆转让协议有明确标的，即车辆。买卖合同标的可以是车辆，也可以是其它商品。

二、车辆转让协议和买卖合同都是平等主体自愿协商的基础达成一致的合同。