第一，代理是行政程序的临时性质，正式任命是行政程序的正式性质。

第二，代理不享受相关职务的有关待遇，正式任命享受相关规定的有关待遇。

第三，代理的任期存在不确定性，可以随时撤换，正式任命的任期有相关规定的时间确定性。

第四，代理一般不能成为上一级组织成员，正式任命有可能进入成为上一级组织成员。