“主要指”是话事人对自己前面描述的事情进一步补充说明，让听众更清晰了解自己的真正意图和重点关注的人或事。

“尤其”是话事人对自己前面描述的诸多事情中的某一事情的强调，或在论述诸多事情后，话事人更进一步想强调另一件事而使用的短语。

从语气来说，“主要指”更平和，重在解释。而“尤其”则有更进一步的含义，重在强调。