马里为热带气候，由北向南分为热带沙漠、热带草原和热带雨林3种气候区域。全年分为热季（3月至5月）、雨季（6月至10月）和凉季（11月至次年2月）。热季酷热干燥，最高气温可达50℃雨季多阵发性狂风暴雨，全年雨量基本集中于雨季凉季最低气温也不低于14℃。全国平均降雨量为50～1300mm，由北向南渐进递增。