因为萧山在历史上长期属于绍兴府，建国后才被划入杭州。历史上，吴越文化是以钱塘江为界，江北为吴文化，江南为越文化，而萧山属于越文化，杭州主城区属于吴文化。因为文化因素的影响，萧山与杭州主城区融合也较为缓慢。

但是历史文化因素是其次，主要是杭州独特的财政体系造成的。杭州主城区区级财政收入是由市级统筹管理的，而萧山的财政收入是独立管理，因为萧山之前是县级市萧山市，所以撤市设区后，财政收入依然保持独立。