金水河的源头有两个：东源为正源，发源于鄂东南的幕阜山北麓，咸宁桃花山西南坡

西源为偏源，发源于鸡冠山南的鸣水泉，自东南向西北，流经湖北咸宁，蒲圻，嘉鱼，武昌（今武汉江夏区），途中纳入西凉湖，斧头湖，团墩湖，上涉湖，鲁湖，后石湖等湖之中，通过武汉市金口街的金水闸，由金口流入长江，全长144公里，武汉江夏区流程41.5公里，流域面积为2676平方公里。