党员身份由所在单位的党支部确认。这是因为，入党申请人申请加入中国共产党，必须向所在单位党组织写出并递交入党申请书，被批准加入党组织也必须通过所在单位党员大会批准加入，加入了党组织后即具有了党员身份，并持有了党员证。可见，党员身份是由党的基层组织即党支部确定的。