因为设计大不一样了。

新剧场版序和破和旧版内容大致相同，而新剧场版Q和终章则是完全不同于旧版的颠覆性作品。

在旧版中为nerv作战指挥官的葛城美里在新剧场版Q中自己成立了一个反抗nerv的组织wille，对抗nerv发起的补完计划。