红丸案后，天启帝下旨问罪。将崔文升发遣南京，李可灼遣戍边。疆宦官魏忠贤当权，又将礼部尚书孙慎行开除了官籍，夺去所有官阶封号，发配流戍。大肆处罚东林党人，高攀龙投池而死。