如果因为在禁钓区域钓鱼内渔政部门罚款了的话，一般来说是不会留下案底的。只不过在进行罚款时，执法人员一般都会讲被处罚者的身份证号记录下来。在第二次查到同一人违法钓鱼的情况时，执法机关就有可能会以累犯等为理由加重对其的处罚。