区别是：丁酸梭菌是能产生丁酸的菌种，主要是针对养殖动物肠道，可以修复肠道，提高养殖动物的吸收功能。em菌主要是用来发酵有机肥、饲料等等。用在水体中分解有机质，净化水体，促进肥料、残饵、粪便等等的转换，给藻类提供所需营养盐，促进肥水。