妖神记小说中肖凝儿最后的结局是被林枫杀死。

妖神记小说中肖凝儿最后被林枫杀死，肖凝儿在妖界与仙界开启圣战的时候独自一人来到妖界的圣妖城驻守，随后在仙界大军攻打妖界圣妖城的时候肖凝儿与仙界的林枫大战一场，最终肖凝儿不敌林枫被一剑击杀。