碘伏对铜等金属有一定的腐蚀性，不能用于这些金属制品的消毒和浸泡物品。碘伏对于有机物(比如油，皂脂类等)有一定的对抗性，如果遇到对这类物品的消毒，应该增加药物浓度，或是延长时间，以保证消毒效果。

碘酒是游离状态的碘和酒精的混合物，其消毒作用的原理仍是游离状态的碘原子的超强氧化作用，可以破坏病原体的细胞膜结构及蛋白质分子。如使用得当，其结果非常可靠。但是，因为其强大的氧化能力，也可能造成皮肤组织的损伤。