小区违规建设的车库，要分成两种情形来判断如何处罚。

第一种情形是开发商或者物业违规建设车库，这种行为属于法人行为，住建部门或者规划部门可以按照消防法或者规划相关法律法规对开发商或者物业公司进行处罚，通常是责令拆除，并处三万到三十万元罚款。

如果是居民个人违规建设车库，这属于个人行为，如果不占用消防车通道、防火间距等，那么，一般由综合行政执法部门责令当事人拆除，限期内不拆除的，综合行政执法部门会强制拆除如果占用了消防车通道、防火间距，那么消防救援机构还会对个人处以罚款，一般是五百元以下罚款。