区别在于：医院是否会保存孕妇在怀孕期间所有产检的检查结果。

1、建档，这相当于是医院免费为孕妇建立个人档案，各项检查结果都包含其中，所以孕妇最好是能够在怀孕的初期第一次产检的时候就进行建卡，否则到了怀孕的晚期，医院并不能够完整的知道孕妇整个孕期的产检状态，也就不能充足的了解孕妇的身体状态和不能预测可能出现的危险。

2、不建档，就不存在个人档案，孕妇各项检查医生不能第一时间知道，也没有医生会主动联系孕妇，发生异常妊娠结局的几率相应的增加。