三方协议学校审核以后是不能再修改的。因为三方协议是学校、用人单位和应届毕业生三方签订的协议，其信息也是得到三方认证的，特别是学校审核以后就要换取报到证，所以不能再修改任何信息，如果修改信息需要重新换取新的三方协议。