虹膜识别最开始诞生的思路是在1885年，ALPHONSEBERTILLON将利用生物特征识别个体的思路应用在巴黎的刑事监狱中，当时所用的生物特征包括:耳朵的大小、脚的长度、虹膜等。

直到了1987年，国外的眼科专家ARAN SAFIR和LEONARDFLOM才首次提出利用虹膜图像进行自动虹膜识别的概念，再到1991年，美国洛斯阿拉莫斯国家实验室的JOHNSON实现了一个完整的自动虹膜识别系统。

再然后通过对系统不断的完善，1993年JOHNDAUGMAN实现了一个高性能的自动虹膜识别原型系统。