飞行控制计算机的原理是飞机和自动控制系统按负反馈的原则组成闭环回路(飞行控制回路)，实现对飞机的稳定与控制。

在这个闭环回路中被控制量主要有飞机的姿态角、 飞行速度、 高度和侧向偏离等，控制量是气动控制面的偏角和油门杆的位移。

运用经典控制理论或现代控制理论可以分析和综合飞行控制回路（见控制理论），从而设计出飞机飞行控制系统。

为了确切地描述飞机的运动状态，需要选定适当的坐标系，常用的坐标系是机体坐标系、速度坐标系和地球坐标系