1、种属不同。

银杏：属于银杏纲银杏目银杏科银杏属。

红豆杉：属于松杉纲红豆杉目红豆杉科红豆杉属。

2、外形差异。

银杏：高大乔木，高度可达40米，胸径可达4米，树皮粗糙，纵裂纹，呈灰褐色。

红豆杉：常绿乔木，灌木，小枝不规则互生，叶条生，呈螺旋状生长，种子坚果状。