和田玉颜色不均匀的原因是玉的结构——纤维状交织结构。

这种结构表现为矿物颗粒大小不等、呈纤维状无定向性排列，相互穿插绞合、交织在一起，并且不同的矿物颗粒间镶嵌紧密。

由于这种交织结构的存在，在矿物颗粒之间形成了一种粒间机械结合力，这种结合力的存在使碧玉在受到外力作用时不易碎裂，这是其高韧度的主要原因。另外，一些纤维状透闪石矿物颗粒细长，聚集以束状整体出现。也正是因为这种纤维交织结构不定向的排列，也形成了它本身颜色的深浅差别。