上海到日本京都没有航线，因为京都没有飞机场，上海到京都的话，只能走大阪中转才可以。从上海浦东机场起飞到达大阪关西机场的飞行时间，大约在1小时40分钟左右，落地出关后，关西机场地下层内，搭乘JR关空特快“はるか”（遥）号，经大阪市区，高槻市区后，全程约1小时10分左右，便可到达JR京都站。