不会停保。 医保断交3个月缴费后，缴费年限不会清零，但是将会暂停计算累计缴费年限，并且在医保停缴的次月将不能享受医保报销待遇。 缴费单位必须按月向社会保险经办机构申报应缴纳的社会保险费数额。

个人账户余额在重新缴纳医保后，将会激活，可以继续使用，也就是说，个人缴纳的医保金额不会清零。医保缴费中断3个月，将重新计算其连续参保年限。医保清零是针对参保人缴费年限的清零而不是个人账户清零，逐月划入个人账户的金额不会清零。