珍珠上有小洞是正常的。

俗语说:“无瑕不成珠”天然的珍珠因为它的没有瑕疵而显得非常珍贵，从宏观意义上来讲珍珠是没有瑕疵的，但是有微观意义上来讲珍贵是存在瑕疵的。

从物理构造来讲，珍珠的形貌是由碳酸钙结晶体与壳角蛋白垒积在珍珠表面的反映。在理想状态下，其表面应该是光滑干净的，但实际上由于外界环境的复杂多变和蚌(贝)体的健康程度不同，使珍珠表面往往偏离理想状态，出现一些瑕疵。