区别就是两者都是介词+the +hill构成的短语，介词不同，短语意思也不同，具体的不同如下

in the hills中文意思是在山里

We can't fight in the hills.我们不能在崇山峻岭中战斗。

on the hill中文意思是在山上，在小山上

S'pose we tackle that old dead-limb tree on the hill t'other side of Still-House branch?咱们去鬼屋河岸对面小山上那棵枯树那儿挖，怎么样