大连海洋大学现在有3个校区，分别为：黄海校区、渤海校区和瓦房店校区。其中，瓦房店校区最好。

瓦房店校区学科体系完善，优势特色学科明显。有省(部)级重点学科4个：水产一级学科为辽宁省一流特色学科，该学科在2012年教育部第三轮学科评估中名列第三水生生物学、动物遗传育种与繁殖2个二级学科被确定为辽宁省优势特色重点学科水产养殖二级学科为农业部重点学科。有省哲学社会科学重点建设学科1个。拥有国家级多学科协同创新平台——大连海洋大学新农村发展研究院。