饿了么商家的扣费规则如下：

1、打开饿了么商家版APP，在登录自己的账号之后可以看到店铺管理，点进去会有一个数据中心。

2、在数据中心中就可以看到营业额和支出了，还可以看到一个预计净收入，为商家提供收益参考。数据中心中还可以查看订单数量和平均客单价格