黄豆芽和绿豆芽根部只要是正常生长的，都可以不用去掉。

豆芽生根是一种常见的现象，当豆类植物在一定的温度与湿度的条件下就开始生根发芽，尽量使豆芽处于干燥或者是低温状态下保存，可以放在地窖或者冰箱里，还可以将豆芽泡在水里，平时要在短时间内尽快地吃掉豆芽，否则豆芽不新鲜产生一些毒素对人体产生伤害会引起腹泻腹痛等症状，需要多吃一些新鲜的水果蔬菜，补充维生素和纤维素，注意饮食的平衡。

自然培育的豆芽菜，根须发育良好，无烂根、烂尖现象，而用化肥浸泡过的豆芽菜，根短、少根或无根。