可以的，不过你最好只是草拟，要让当事人最后要抄写一遍。帮同事写分居证明本来无可厚非，但是，这件事是同事的一件人生大事，必须慎重对待，所以，在你草拟之后，让他抄写一遍，不仅可以让他熟悉条款，还能查遗补缺，而你也可以在事后不承担责任。