区别如下：

关联启动是当手机运行一个软件并且需要在软件内打开第二个软件就是关联启动，自启动是当手机开机的时候软件自动开启运行状态叫自启动！

对于关联功能，有些用户会觉得应用关联相互唤醒后台启动使用起来更方便。但是一般清理进程之后消息、推送都会出现接收不到的情况，为了保证清理进程之后依然可以收到推送。