主要区别有三个：

1、体型结构不同：短尾蝮蛇的眼和鼻之间有颊窝结构，而圆斑蝰蛇的眼和鼻之间是没有颊窝结构的。

2、生殖方式不同：短尾蝮蛇多数是卵胎生的，而圆斑蝰蛇既有卵生，又有胎生的。

3、分布范围不同：短尾蝮蛇的分布范围比较广泛，而圆斑蝰蛇的分布范围比较小。