中证1000和深证1000是完全不同的2个指数。

中证1000指数是由中证指数有限公司编制，其成份股是选择中证800指数之外规模偏小且流动性好的1000只股票组成，中证1000指数包含了沪深2市流动性好的小市值成份股。

深证1000指数是指由深圳证券交易所编制的股价指数，只局限深市的相关股票。