南通没有医科大学，但是有南通大学医学院，也是原来的南通医学院，学校有南通地区最好的医院专业。现有国家重点学科培育建设点1个、江苏省高校优势学科1个、江苏省一级学科重点学科2个、一级学科博士学位授权点2个、一级学科硕士学位授权点5个，博士后科研流动站2个。拥有国家级和江苏省实验教学示范中心各1个，国家级虚拟仿真实验教学中心1个，江苏省重点实验室1个，南通市重点实验室2个，还设有基础医学研究中心、临床医学研究中心及15个校级研究机构。