CoASH分子内含有腺苷酸，D-核糖，磷酸，焦磷酸，泛酸和巯基乙胺的残基。腺嘌呤以beta-糖苷键与核糖的第一个碳原子相连。

D-核糖的第五位碳与焦磷酸基团相连。焦磷酸基团的第二个磷酸基团以脂键形式与泛酸相连。泛酸又以酰胺键的形式与巯基乙胺相连。巯基乙胺的游离端是一个巯基（-SH），这是CoA的活泼基团.他在酶促转乙酰基的反应中，起着接受或提供乙酰基的作用。