灰原哀被困在木屋出现在第751-752集《迫近灰原的神秘黑影》。

剧情中少年侦探团偶然目击杀人事件，犯人追逐少年侦探团想要灭口。灰原哀等人不得不躲在小木屋中，但是犯人打算烧毁木屋。最后灰原哀不得不吃下APTX4869解药恢复成年人身体，用斧头把木屋劈开。但是过程中成年灰原哀被录了下来，最终被安室透发现。