水果玉米的甜是多糖，水果玉米之所以很甜，口感像水果一样，主要是因为其胚乳中的水溶性多糖含量高而淀粉含量少，所以早期的水果玉米是传统育种技术的产物，和转基因技术没关系。

后来，随着转基因技术的迅速发展，各种转基因玉米也被推向市场，难免不乏一些自然栽培品种的水果玉米为了改良某些性状而通过转基因技术加以改造，成为新的转基因水果玉米品种被推向市场上，所以，现在市面上的水果玉米很多说清楚究竟是不是转基因品种了。